Terminé

COVID-19 NGSNGS Diagnostic in COVID-19 Hosts - Genetic Cause Relating to the Course of Disease Progression

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Ce qui est testé

Whole Genome Analysis

+ T-cell receptor (TCR) repertoire

+ SARS-CoV-2 viral composition

Génétique
Qui peut participer

COVID-19+9

+ Infections à Coronaviridae

+ Infections

À partir de 18 ans
+4 critères d'éligibilité
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Comment se déroule l'étude

Étude diagnostique

Interventionnel
Date de début : octobre 2020
Voir le détail du protocole

Résumé

Sponsor principalUniversity Hospital Tuebingen
Dernière mise à jour : 28 janvier 2026
Issu d'une base de données validée par les autorités. Revendiquer en tant que partenaire

Date de début de l'étude : 21 octobre 2020

Date à laquelle le premier participant a commencé l'étude.

This study aims to recruit adult persons with diagnostically confirmed Corona-Virus- Disease-19 (COVID-19) infection and with different disease manifestation who are included into diagnostic or therapeutic care at the University Hospital Tübingen (UKT). The COVID-19 Next-Generation-Sequencing (NGS) study aims to cover as many patients in Germany as possible. It is expected to include in Phase 1 (pilot study): 250 patients with different disease manifestation (extreme phenotypes) and individual risk factors by whole genome analysis Phase 2 (verification study): 1.000 clinically well-defined patients to ensure a broader range of overlapping phenotypes, to verify data from the pilot study. Phase 3 (confirmation study): > 10.000 patients to increase the power (anticipated).

Titre officielNGS Diagnostic in COVID-19 Hosts - Genetic Cause Relating to the Course of Disease Progression
NCT04364828
Sponsor principalUniversity Hospital Tuebingen
Dernière mise à jour : 28 janvier 2026
Issu d'une base de données validée par les autorités. Revendiquer en tant que partenaire

Protocole

Cette section fournit des détails sur le plan de l'étude, y compris la manière dont l'étude est conçue et ce qu'elle évalue.
Détails du design

1000 participants à inclure

Nombre total de participants que l'essai clinique vise à recruter.

Diagnostic

Cette étude évalue de nouvelles méthodes pour diagnostiquer ou identifier une maladie, afin de la détecter plus facilement et plus tôt.

Éligibilité

Les chercheurs recherchent des patients correspondant à une certaine description appelée critères d'éligibilité : état de santé général ou traitements antérieurs du patient.
Conditions
Critères

Tout sexe

Le sexe biologique des participants éligibles à s'inscrire.

À partir de 18 ans

Tranche d'âge des participants éligibles à participer.

Volontaires sains non autorisés

Indique si les individus en bonne santé et ne présentant pas la condition étudiée peuvent participer.

Conditions

Pathologie

COVID-19Infections à CoronaviridaeInfectionsMaladies pulmonairesPneumoniePneumonie viraleInfections des voies respiratoiresMaladies des voies respiratoiresInfections à virus ARNMaladies viralesInfections à CoronavirusInfections à Nidovirales

Critères

3 critères d'inclusion nécessaires pour participer
COVID-19 infection confirmed
COVID-19 disease manifestation
Age > 18 years
Un critère d'exclusion empêche la participation
Missing informed consent of the patient/ legal guardian/ relatives

Plan de l'étude

Découvrez tous les traitements administrés dans cette étude, leur description détaillée et ce qu'ils impliquent.
Groupes de traitement
Objectifs de l'étude

3 groupes d'intervention sont désignés dans cette étude

Cette étude ne comporte pas de groupe placebo. 

Groupes de traitement

Groupe I

For 150 patients from the extreme phenotypes - complementary to Whole Genome Analysis of each patient also Whole Transcriptome will performed Analysis; DNA methylation analysis using EPIC arrays will be performed in the pilot study (phase 1). Identically, in phase 2 starting from month 4, will be generated WGS, Whole transcriptome sequencing (WTS), and methylation data of the 500 patients. Epigenetic changes are likely to occur upon Corona infection. Subsequently, genome and epigenome data with RNA expression pattern will be correlated.

Groupe II

Focus on longitudinal analysis of TCR repertoire of CD4+ and CD8+ T cells from blood samples (PBMCs) from clinically characterized patients (n = 24). The bulk- T-cell receptor (TCR) sequencing will be performed at different time points during the course of disease progression and recovery.

Groupe III

The Severe Acute Respiratory Syndrome-Corona Virus-2 (SARS-CoV-2) viral composition is determined by Next Generation sequencing (different protocols for enrichment are available, and are currently being tested to successfully analyse the virus from different isolates). It is known that SARS-CoV-2 sequence is changing at least one position every second passing from person to person. Numerous variants have been described deriving from 3 different ancestral viruses (named A, B, and C) reflecting different distributions in East Asia, Europeans and Americans. At it is anticipated that other (super)infections may add to the severity of the infection and disease course, the entire metagenome of the throat is being sequenced and analyzed as well.

Objectifs de l'étude

Objectifs principaux

Objectifs secondaires

Centres d'étude

Ce sont les hôpitaux, cliniques ou centres de recherche où l'essai est conduit. Vous pouvez trouver le site le plus proche de vous ainsi que son statut.

Cette étude comporte 1 site

Suspendu

University Hospital Tübingen

Tübingen, GermanyOuvrir University Hospital Tübingen dans Google Maps
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